武汉康测医学检验有限公司成立于2016年1月,核心团队由来自武汉大学、UCSD的国家“青年千人”、“3551人才”等高精尖人才组成,现有员工80余人,60%为硕士及以上学历。公司坐落在国家级经济开发区武汉光谷生物城国家生物产业基地,办公实验面积3400m2。公司拥有高通量的核酸提取、QC、建库、pooling自动化生产平台和10xGenomics单细胞测序平台。
康测医学致力于新一代基因组学技术生命科学研究领域,专注于二代测序产品服务领域,是国家高新技术企业、3551创业人才企业和科技小巨人企业。目前已经申请发明专利5项、授权1项,软件著作权数十个。在生命科学研究服务领域,康测医学成功开发了全平台数字标签(UMI)去重纠错高通量测序技术;建立了全物种、全组织类型覆盖的表观遗传学研究手段,目前在植物、微生物、动物复杂组织的表观遗传研究领域占据绝对领先的技术地位。
武汉康测医学检验有限公司使用Illumina HiSeq X Ten二代测序平台,和PacBio三代测序平台以及高性能计算平台。计算平台具有海量并行存储系统,存储容量最高可达EB级,计算资源总量在TB级别以上,能够完全胜任基本的数据分析需求,乃至大型基因组的组装。
二代测序平台
HiSeq X Ten以Illumina成熟的边合成边测序技术为基础,采用了多个先进的设计特点,以产生超高的通量。HiSeq X Ten包含数十亿个纳米孔的流动槽,以及新的簇生成试剂让数据密度显著增加。利用最先进的光学设备和更快的试剂,测序速度得到提升。每台HiSeq X Ten可运行单流动槽或双流动槽,他们都支持2×150bp的读长,一台仪器每天可产生600Gb的数据量。
三代测序平台
第三代测序技术即单分子实时测序技术。这一新技术无需进行基因组扩增,可直接从DNA片段获得测序数据,与传统标准方法相比,所需的DNA量也相当少,用量可低至不到1ng。PacBio测序具有长读长(平均读取长度达到10,000 bp或者更长)、高准确性、高敏感性、高均一性等优点,而且可直接获取转录组可变剪接和碱基修饰信息。
10X Genomics
10x Genomics单细胞转录组测序,通过微流体芯片将单个细胞分配到单个油包水液滴中,进行反应。同时可以获得 1,000-10,000个细胞的表达信息,从而实现对细胞群体的划分与细胞群体间基因表达差异的检测,是肿瘤细胞异质性、免疫细胞群体检测以及胚胎发育研究的黄金方法。