转录因子ChIP测序-武汉康测医学检验有限公司

转录因子ChIP测序

产品简介

Chip-seq：DNA结合蛋白功能的研究工具

人类基因组的20000个蛋白编码基因中，约有2000个具备DNA结合的能力。这些DNA结合蛋白包括染色体组装的组蛋白、DNA复制相关结构蛋白、核酸酶和DNA聚合酶，转录相关转录因子和RNA聚合酶等。其中 转录因子的数量最多，约有1500个。

转录因子蛋白通常具有DNA结合结构域和功能结构域。根据DNA结合结构域的特征，转录因子可以被划分成数十个家族。通过识别增强子或启动子的相应序列结合到DNA上之后，转录因子可以通过多种方式行使对转录的调控功能：

部分转录因子结合到转录起始位点附近的DNA启动子序列，并帮助形成转录起始复合物；
部分转录因子结合调节序列，例如增强子序列，刺激或抑制相关基因的转录；
部分转录因子（先驱转录因子），则可以招募修饰酶，调控基因的组蛋白修饰和DNA甲基化状态，改变染色质构象从而调控基因的转录；

Chip-seq就是研究这些DNA结合蛋白功能的重要工具。Chip-seq测序（CHromatin ImmunoPrecipitation and high-throughput SEQuencing）是将染色质免疫共沉淀和高通量测序相结合的技术。通过特异性抗体，将待研究的目标DNA结合蛋白-DNA形成的复合物沉淀下来，从而获取该蛋白结合的DNA。通过对DNA进行高通量测序，即可获得该蛋白在染色体上结合的情况。

Chip-seq的流程包括细胞/组织交联、细胞核提取、染色质片段化、免疫共沉淀、DNA回收、文库构建、高通量测序和生信分析等一系列步骤，如下图所示：

服务流程

您只需要：

1、提供目标蛋白和样品信息，评估可行性；

2、提供样品和抗体，剩下的我们来做；

3、收到实验和分析报告，使用数据；

产品优势

我们是专业的Chip-seq技术服务供应商：

严格的质控体系：我们的服务提供三重质检，保证结果的可靠性；
领先的技术：我们有近千次IP锤炼出来的IP体系；
全物种覆盖：我们有最先进的细胞核分离纯化技术，再罕见的物种、再复杂的组织类型，都不是问题；
自动化IP工作站：我们建设了国内唯一的自动化IP工作站，可以在1天时间内完成32个样品的平行IP实验，缩短项目周期、提高结果稳定性；

项目经验丰富：我们累计提供了几十种组蛋白、转录因子，50多个物种的上千次Chip-seq服务；

技术痛点

一个好的Chip-seq实验，需要具备以下素质：

1）良好的免疫共沉淀效果：足够的特异性和足够的IP效率；

2）分析结果应该符合目的蛋白已知的结合模式。

实测数据

转录因子

Chromatin Remodelling Protein

客户文章

Juan Dong et. al, UHRF1 suppresses retrotransposons and cooperates with PRMT5 and PIWI proteins in male germ cells. Nat Commun (2019) （IF：12.121）
Ge Sun et. al, An H3K4me3 reader, BAP18 as an adaptor of COMPASS-like core subunits co-activates ERα action and associates with the sensitivity of antiestrogen in breast cancer, Nucleic Acids Research, Volume 48, Issue 19, 4 November 2020（IF：11.561）
Tian X, et. al, The miR-5694/AF9/Snail axis provides metastatic advantages and a therapeutic target in basal-like breast cancer - ScienceDirect[J]. 2020. （IF：8.986）
Wang, S et. al, ZNF703 prmotes tumor progression in ovarian cancer by interacting with HE4 and epigenetically regulating PEA15. J Exp Clin Cancer Res 39, 264 (2020). （IF：7.9）
Guo Z et. al, UTX/KDM6A deletion promotes the recovery of spinal cord injury by epigenetically triggering intrinsic neural regeneration[J]. Molecular Therapy — Methods & Clinical Development, 2020. （IF：4.533）
Wenjing Liang et. al, HMGB1 upregulates NF-kB by inhibiting IKB-α and associates with diabetic retinopathy. Life sciences (2019) （IF：3.4）
Xinyang Zhang et. al, A Novel Regulator of Preadipocyte Differentiation,Transcription Factor TCF21, Functions Partially Through Promoting LPL Expression. Front Physiol (2019) （IF：3.367）

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