检测技术篇
1.什么是基因检测?
基因检测是通过对血液、其他体液或组织细胞中的DNA信息进行检测及分析,从而进行疾病诊断、疾病风险预测、个体化用药评估等应用的一种技术。目前常用的基因检测包括:DNA测序技术、基因芯片技术等
2.什么是panel?
panel是 NGS(二代测序,高通量测序技术)技术发展起来的一个词语, 主要指同时检测多个基因、多个位点。基因检测的panel官方称之为“基因包”, 也可以称之为“基因组合”,商业化的市场习惯称之为“基因套餐”。 就基因panel本身来说,其实并没有指明所检测的基因数目应该是多少。几个基因可以是一个panel,几十个基因也可以是一个panel,几百上千个基因也可以是一个panel。就panel大小来说,不仅需要看检测基因的数目,还需要看基因所覆盖的区域大小。
3.肿瘤基因检测是不是panel越大越好?
肿瘤基因检测产品(大中小panel)都有自己的优势,在选择检测项目时,需要考虑自身的需求与经济能力。比如刚确诊的时候,可以选择几个/几十个基因的panel来进行检测。但是如果晚期多处转移的时候,尤其是耐药的患者,基因突变比较复杂紊乱,可以选择更大的基因panel去检测。如果需要进行免疫治疗,想检查TMB,MSI及MMR的情况,也可以选择大panel进行检测,总之,项目的选择需根据肿瘤的类型,检测目的及意义,经济压力,消费能力等具体的情况综合选择。
4. 测序深度是指什么?
对于靶向测序来说,测序深度是指比对到目标测序区间(targeted region)的测序数据量(碱基总数)与该区间大小的比值,它是评价测序量的重要指标之一。 测序深度分为测序深度分为原始测序深度(raw data)和有效测序深度(clean data)。 测序得到下机数据是原始测序数据,其中会包括一些低质量或重复的数据。通过生信算法去除低质量的碱基和重复的检测序列后,得到能够比对到目标测序区间的用于后续分析的高质量序列,即有效测序深度。
5.什么是风险建库?有哪些风险?
选择风险建库时,实验会存在一定失败风险,大部分可能会成功。起始DNA总量越高越容易成功,但一旦低于实验室要求的DNA起始总量预警线的,实验就无法保证100%成功。可以选择风险建库,但风险建库如果导致后续测序数据量不足的,小部分是需要重新补测的,极个别还会通知重新补送样本。
武汉康测医学检验有限公司由来自武汉大学、华中农业大学、UCSD等的国家“青年千人”、“3551人才”等高精尖人才发起,现有员工180余人,50%为硕士及以上学历。公司坐落武汉东湖高新技术开发区南山自贸港,办公实验面积3100㎡。公司先后获得国家高新技术企业、3551创业人才企业、3551长期创新人才企业、科技小巨人企业、瞪羚企业等认证。
康测医学致力于高通量测序技术在泛实体瘤围手术期、血液肿瘤的诊断及预后、遗传等领域的临床检测应用,开发的技术已申请发明专利5项、授权3项,软件著作权数十个。公司以业内唯一的基于多重锚定不对称PCR的SMP液态活检+分子溯源技术为核心,为患者提供高度灵敏、准确的MRD检测服务;同时提供一站式、自动化MRD建设方案。
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